Candidatus Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii on endosymbioottinen gammaproteobakteeri. Sillä on pienin tunnettu genomi kaikista bakteereista.
Laji on endosymbiontti, jota esiintyy kaikissa psyllideiksi kutsutuissa, ploemimahlaa syövissä hyönteislajeissa. Endosymbionttia esiintyy erikoistuneessa rakenteessa, jota kutsutaan bakterioomiksi.
Vuonna 2006 erään Ca. C. ruddi -bakteerin perimä sekvensoitiin RIKENissä Japanissa ja Arizonan yliopistossa. Genomi on 159 662 emäsparin pituinen pyöreä kromosomi, jossa on suuri koodaustiheys (97 %), paljon päällekkäisiä geenejä ja lyhennetty geenien pituus. Ennustettujen geenien määrä oli 182, mikä on myös alhaisin ennuste (NCBI-Genome). Lukuisat elämälle välttämättöminä pidetyt geenit näyttävät puuttuvan, mikä viittaa siihen, että laji on saattanut saavuttaa organellin kaltaisen aseman.
Mycoplasma genitaliumin, jonka genomi on pienin kaikista vapaasti elävistä organismeista, genomissa on 521 geeniä.
Kysymyksiä ja vastauksia
Q: Mikä on Candidatus Carsonella ruddii?
V: Candidatus Carsonella ruddii on endosymbioottinen gammaproteobakteeri, jota esiintyy kaikissa psyllideiksi kutsutuissa, floemimahlaa syövissä hyönteislajeissa.
K: Kuinka suuri on Candidatus Carsonella ruddii -bakteerin genomi?
V: Candidatus Carsonella ruddii -bakteerin genomi on pienin tunnettu bakteerin genomi, ja se on 159 662 emäsparin pituinen pyöreä kromosomi.
K: Kuinka monta geeniä Candidatus Carsonella ruddii -bakteerissa ennustetaan olevan?
V: Candidatus Carsonella ruddii -bakteerissa ennustettujen geenien määrä on 182, mikä on alhaisin ennuste (NCBI-Genome).
K: Mikä on Candidatus Carsonella ruddii -lajin genomin koodaustiheys?
V: Candidatus Carsonella ruddii -lajin genomin koodaustiheys on korkea, 97 %.
K: Mikä on bakterioomi?
V: Bakterioomi on erikoistunut rakenne, jossa endosymbionttit esiintyvät Candidatus Carsonella ruddiissa.
K: Mitä Candidatus Carsonella ruddii -bakteerin genomista puuttuu?
V: Candidatus Carsonella ruddii -lajin genomista näyttää puuttuvan lukuisia elämälle välttämättöminä pidettyjä geenejä, mikä viittaa siihen, että laji on saattanut saavuttaa organellin kaltaisen aseman.
K: Miten Candidatus Carsonella ruddii -lajin genomi vertautuu Mycoplasma genitaliumin genomiin?
V: Mycoplasma genitaliumin, jonka genomi on pienin kaikista vapaasti elävistä organismeista, genomissa on 521 geeniä, mikä on huomattavasti enemmän kuin Candidatus Carsonella ruddii -organismin ennustettujen geenien määrä.
