Candidatus
Candidatus on termi bakteerien taksonomiassa (tieteellisessä luokittelussa).
Se on merkintä sellaisen bakteerin nimen eteen, jota ei voida kasvattaa agarilevyllä tai missään muussa bakteriologisessa viljelyssä. Esimerkki olisi "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae". Candidatus-statusta voidaan käyttää, kun laji tai suku on hyvin tutkittu, mutta sitä ei voida viljellä. Nykyään paljon tietoa saadaan 16S-ribosomaalisen RNA:n sekvenssianalyysin avulla.
Historia
Jotta laji voidaan julkaista oikein, bakteerit on eristettävä, viljeltävä, kuvattava ja talletettava bakteriologiseen viljelykokoelmaan. Jotkin bakteerit vaativat kuitenkin erityiset kudosviljelyolosuhteet, eikä niitä voida säilyttää bakteriologisissa viljelykokoelmissa. Tällaisia ovat esimerkiksi bakteerit, jotka elävät muiden organismien tai solujen sisällä. Tällaisia ovat muun muassa pakollisesti solunsisäiset patogeenit ja endosymbiontit, hyönteissymbiontit sekä valtameristä tai lietteestä peräisin olevat populaatiot.
Vuonna 1994 Murray ja Schleifer julkaisivat taksonomisen huomautuksen. He suosittelivat uuden epämääräisen luokan (Candidatus) perustamista tietyille oletetuille taksoneille, joita ei voitu kuvata riittävän yksityiskohtaisesti uuden taksonin perustamiseksi. Lisäksi suositeltiin Candidatus-luettelon laatimista International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology -lehteen.
IRPCM Phytoplasma/Spiroplasma Working Team - Phytoplasma taxonomy group -työryhmän mukaan Candidatus-lajin lyhenteen pitäisi olla Ca.
Kysymyksiä ja vastauksia
K: Mikä on Candidatus?
V: Candidatus on bakteerien taksonomiassa käytetty termi, joka viittaa sellaisen bakteerin nimen eteen laitettuun merkintään, jota ei voida kasvattaa missään muussa bakteriologisessa viljelyssä.
K: Mihin tarkoitukseen Candidatusta käytetään?
V: Candidatus-statusta käytetään, kun laji tai suku on hyvin tutkittu, mutta sitä ei voida viljellä.
K: Voidaanko Candidatus-asemasta antaa esimerkki?
V: Kyllä, esimerkki Candidatus-statuksesta on "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae".
K: Miksi joitakin bakteereja ei voida viljellä?
V: Joitakin bakteereja ei voida viljellä, koska ne eivät kasva agarlevyllä tai missään muussa bakteriologisessa viljelyssä.
K: Miten bakteereista saadaan nykyään paljon tietoa?
V: Bakteereista saadaan paljon tietoa 16S-ribosomaalisen RNA:n sekvenssianalyysin avulla.
K: Käytetäänkö Candidatusta bakteereista, joita ei ole tutkittu hyvin?
V: Ei, Candidatusta käytetään bakteereista, joita on tutkittu hyvin mutta joita ei voida viljellä.
K: Onko Candidatus yksinomaan bakteereihin tarkoitettu?
V: Kyllä, Candidatus on termi, jota käytetään yksinomaan bakteerien taksonomiassa.
