Complete Genomics yritys DNA-sekvensointi ja genomipalvelut BGI:n tytäryhtiö

Complete Genomics (CG), Mountain View, Kalifornia, on biotieteiden alalla toimiva yritys, joka tarjoaa kaupallisia DNA-sekvensointi- ja analyysipalveluja erityisesti ihmisen genomiin keskittyen. Yritys on kehittänyt kaupallisen sekvensointialustan ja koko genomin analyysiputken, jotka on optimoitu suurten aineistomäärien käsittelyyn ja tarkkaan varianttien tunnistukseen. Palveluihin kuuluvat koko genomin sekvensointi (WGS), varianttien tunnistus, rakennevariantit, kopiolukumuutokset sekä bioinformatiikka- ja tulkintaraportit tutkimus- ja kliinisiin projekteihin.

Historia ja omistajuus

Maaliskuussa 2013 Complete Genomicsin osti BGI-Shenzhen, maailman suurin genomipalveluyritys. BGI on 4000 työntekijän yritys Shenzhenissä, Guangdongissa, Kiinassa. Se tarjoaa kattavia sekvensointi- ja bioinformatiikkapalveluja kaupalliseen tieteeseen, lääketieteeseen, maatalouteen ja ympäristösovelluksiin. Yrityskauppa yhdisti Complete Genomicsin tarkkaan ihmisen genomiin kohdennetun teknologian BGI:n suurten volyymien tuotantokapasiteettiin ja laajaan palveluvalikoimaan.

Tärkeät saavutukset ja julkiset aineistot

Helmikuussa 2009 Complete Genomics ilmoitti sekvensoineensa ensimmäisen ihmisen genomin käyttäen omaa teknologiaansa ja luovuttaneensa tulokset National Center for Biotechnology Information -tietokantaan. Marraskuussa 2009 CG julkaisi kolmen ihmisen genomin sekvenssitiedot Science-lehdessä, mikä oli merkittävä osoitus kaupallisen, suureen läpimenoon tähtäävän sekvensoinnin kyvykkyydestä. Vuoden 2009 loppuun mennessä CG oli sekvensoinut 50 ihmisen genomia, ja yrityksen työt olivat laajentuneet nopeasti: yritys oli sekvensoinut yli 20 000 genomia (2015).

Sovellusalueet ja tieteellinen merkitys

Complete Genomicsin tarjoamat palvelut ovat tukeneet laajaa kirjoa tutkimuksia ja käytännön sovelluksia, kuten:

• lääketieteellinen tutkimus ja kliiniset genetiikan projektit (esim. harvinaissairauksien ja syövän genomitutkimus),
• populaatio- ja väestögenomiikka,
• biomarkkerien ja perinnöllisten riskitekijöiden tunnistus,
• korkean läpimenon tutkimusprojektit, joissa tarvitaan yhtenäisiä sekvenssi- ja analyysiputkia.

CG:n aineistoja ja menetelmiä on hyödynnetty laajasti tieteellisissä julkaisuissa ja suurissa genomiprojekteissa, ja yrityksen teknologia on ollut keskeinen askel kohti kustannustehokkaampaa ja skaalautuvampaa ihmisen kokogenomin sekvensointia.

Yhteistyöt ja löydöt

Vuonna 2014 Radboudin yliopiston (Alankomaat), Maastrichtin yliopiston lääketieteellisen keskuksen (Alankomaat), Central South Universityn (Kiina) ja Complete Genomicsin yhteistyössä tunnistettiin älyllisen kehitysvammaisuuden tärkeitä syitä koko genomin sekvensoinnin avulla. Tällaiset yhteistyöhankkeet osoittavat, miten kokogenomin sekvensointi voi johtaa kliinisesti merkittäviin löydöksiin ja parantaa diagnoosia ja tutkimusta harvinaisissa sairauksissa.

Nykytila ja vaikutus

Complete Genomics toimii BGI:n tytäryhtiönä ja sen kapasiteetti ja data-analytiikan osaaminen on integroitu BGI:n laajempaan palvelutarjontaan. Tämä yhdistelmä on mahdollistanut entistä suuremmat projektit ja tarjonnut tutkijoille pääsyn laajoihin sekvenssipalveluihin sekä kehittyneisiin bioinformatiikkaratkaisuihin. CG:n ja BGI:n yhteistyö on vaikuttanut merkittävästi genomiikan tutkimuksen ja genomipalvelujen kehitykseen globaalisti.

Kysymyksiä ja vastauksia

K: Mikä on täydellinen genomiikka?

K: Millaisen alustan Complete Genomics loi?

K: Milloin Complete Genomics perustettiin?

K: Kuka osti Complete Genomicsin vuonna 2013?

K: Millaisia palveluja BGI tarjoaa?

K: Kuinka monta ihmisen genomia Complete Genomics oli sekvensoinut vuoden 2009 loppuun mennessä?

K: Mistä Complete Genomicsin ja Radboudin yliopiston, Maastrichtin yliopiston lääketieteellisen keskuksen ja Central South Universityn välisessä yhteistyössä oli kyse?

Hae kirjaimella