Tandemtoisto
Tandemtoistot esiintyvät DNA:ssa, kun nukleotidikuvio toistuu. Toistot ovat vierekkäin, tandemina. Ne ovat useampia kopioita samasta emäsparisekvenssistä, jotka sijaitsevat peräkkäin.
Esimerkki voisi olla: ATTCG ATTCG ATTCG ATTCG, jossa ATTCG-sekvenssi toistuu kolme kertaa.
Terminologia
Jos 10-60 nukleotidia toistuu, sitä kutsutaan minisatelliitiksi. Niitä, joissa on vähemmän, kutsutaan mikrosatelliiteiksi tai "lyhyiksi tandemtoistoistoiksi".
Kun täsmälleen kaksi nukleotidia toistuu, sitä kutsutaan dinukleotidien toistoksi (esimerkiksi: ACACACACAC...).
Kun kolme nukleotidia toistuu, sitä kutsutaan kolminukleotidiseksi toistoksi (esimerkiksi: CAGCAGCAGCAGCAG...). Poikkeavuudet tällaisilla alueilla voivat aiheuttaa trinukleotidien toistuvuushäiriöitä.
Toistoyksikön kopionumero voi olla vaihteleva. Kyseessä on VNTR (variable number tandem repeat).
Käyttää
Tandemtoistumakuvio auttaa määrittämään yksilön perinnölliset ominaisuudet. Tandemtoistot voivat olla erittäin hyödyllisiä vanhemmuuden määrittämisessä. Lyhyitä tandemtoistumismalleja käytetään tietyissä genealogisissa DNA-testeissä.
Geneettisessä sormenjälkitutkimuksessa ja DNA-profiloinnissa DNA:ta tutkitaan kromosomaalisessa DNA:ssa olevista tandemtoistoista.
Viite
1. ↑ Burt A. & Trivers R. 2006. Genes in conflict: the biology of selfish genetic elements. Harvard University Press. "Tandemtoistot" s. 364/6 ja s. 582.
2. ↑ "Peruspareittaisten sekvenssien kopiot voivat toistua peräkkäin pitkin kromosomia: esimerkiksi 40S rRNA-geenit konnien somaattisissa soluissa, joita on noin 500 kappaletta". Mukailtu osoitteesta Biology-Online.org [1].
3. ↑ Tandem Repeat at the US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH) [2]
4. ↑ Alberts, Bruce et al 2002. Solun molekyylibiologia. Garland, G31.
