Molekyylien liikkeiden tietokanta

Database of Macromolecular Motions on internetissä oleva bioinformatiikan tietokanta. Se pyrkii jakamaan proteiinien ja joidenkin RNA:n biologisten molekyylien liikkeet eri tyyppeihin.

 

Kuvaus

Sen tekivät alun perin Mark B. Gerstein, Werner G. Krebs ja Nat Echols Yalen yliopiston molekyylibiofysiikan ja biokemian ryhmässä. Internet-sivun kautta ihmiset voivat hakea tästä tietokonetietokannasta tiettyä liikettä joko proteiinin nimen tai Protein Data Bank -numeron perusteella. Monet ihmiset löytävät tämän tietokannan kuitenkin vain siirtymällä Protein Data Bankin proteiinimerkinnän Internet-sivulta. Molemmista tietokannoista löytyvien proteiinien osalta tämä eri tietokanta antaa usein linkin takaisin tämän Internet-sivuston proteiinien Internet-sivulle.

Tietokonetietokanta sisältää Internet-työkalun tai ilmaisen Software as a service -palvelun ("Morph-palvelin"), jonka avulla myös muut kuin asiantuntijat voivat nähdä tietyt proteiinien liikkeet luomalla lyhyitä liikkuvia kuvia. Liikekuvat tehdään automaattisesti Internet-sivuston tietokoneohjelmistolla. Kun kuva on valmis, Internet-sivusto lähettää käyttäjälle sähköpostiviestin, jossa on tiedot liikekuvasta.

Morph Server -työkalu oli alun perin pikemminkin tutkimustyökalu kuin työkalu elokuvien tekemiseen, ja siksi se tarjosi käyttäjälle vain rajoitetusti mahdollisuuksia hallita renderöintiä, värejä ja kuvakulmaa, ja alkuperäisen menetelmän käyttäminen vaati toisinaan melko paljon tietokoneaikaa. Sivuston alkuperäisen käyttöönoton jälkeen vuonna 1996 Internet-sivustoa on paranneltu, jotta joitakin näistä ongelmista voitaisiin korjata ja uusia asioita lisätä. Muut ihmiset ovat nyt tehneet vaihtoehtoisia järjestelmiä, kuten Albertan yliopiston MovieMaker.

 

AlegsaOnline.com - 2020 / 2023 - License CC3