Djibouti osallistui vuoden 1988 kesäolympialaisiin Soulissa, Etelä-Koreassa. Tämä oli maan toinen osallistuminen olympialaisiin (ensimmäinen oli Los Angelesin olympialaisissa 1984). Djibouti lähetti Soulin kisoihin kuusi urheilijaa, jotka osallistuivat kahteen lajiin: yleisurheiluun ja purjehdukseen.
Edustajat olivat:
- Hoche Yaya Aden — yleisurheilu
- Ismael Hassan — yleisurheilu
- Talal Omar Abdillahi — yleisurheilu
- Hussein Ahmed Salah — yleisurheilu
- Omar Moussa — yleisurheilu
- Robleh Ali Adou — purjehdus
Hussein Ahmed Salah saavutti Djiboutin historian merkittävimmän olympiatuloksen voittamalla pronssia miesten maratonilla. Tämä oli samalla Djiboutin ensimmäinen ja toistaiseksi ainoa olympiamitali. Muut maan urheilijat kilpailivat pääosin eri yleisurheilulajeissa (erimittaisilla juoksumatkoilla) mutta eivät yltäneet palkintosijoille; useimmat jäivät alkueriin tai eivät yltäneet mitalikamppailuun. Robleh Ali Adou edusti maata purjehduksessa.
Soulin olympialaiset pidettiin syyskuun lopussa ja lokakuun alussa 1988 (17.9.–2.10.1988). Djiboutin osallistuminen vuonna 1988 vahvisti pienen joukkueen panosta erityisesti kestävyysjuoksuissa, ja Hussein Ahmed Salahin mitali jäi nopeasti maan urheiluhistorian keskeiseksi saavutukseksi.