Integroni
Integroni on eräänlainen transposoni, liikkuva geneettinen elementti. Se on kaksiosainen geneettinen järjestelmä, jota esiintyy bakteereissa ja ehkä laajemminkin. Sen avulla antibioottiresistenssi siirtyy niin nopeasti eteenpäin. Sitä esiintyy plasmideissa ja kromosomeissa. Vaikka ensimmäinen löydetty toiminto oli antibioottiresistenssi, integronien avulla voidaan siirtää muitakin bakteerien toimintoja (ominaisuuksia).
Transposonit ovat geenien "kaappaus- ja ilmentymiselementtejä", jotka asettavat geenikasetteina tunnetut pienet liikkuvat elementit paikoilleen ja saavat ne toimimaan. Yleensä kussakin kasetissa on vain yksi geeni ja tietty rekombinaatiokohta. Kasetit kantavat esimerkiksi antibioottiresistenssiä koodaavaa DNA:ta (= "geeniä"). Tyypillisesti DNA koodaa entsyymiä, joka pilkkoo (leikkaa) antibioottimolekyylin.
Integronin ensimmäinen osa on geeni, joka koodaa entsyymiä, joka kiinnittää kasetit. Toinen osa on genomissa oleva paikka, johon kasetit lisätään, ja promoottori, joka ohjaa kasetteihin liittyvien geenien ilmentymistä. "Integroni" kuvaa tällaisia rakenteita sekä silloin, kun kasetteja ei ole, että silloin, kun kasetteja on integroitu. Kasetit voidaan lisätä paikkaan, ne voidaan leikata pois ja niissä voi tapahtua horisontaalinen geeninsiirto.
Kysymyksiä ja vastauksia
K: Mikä on integroni?
A: Integroni on eräänlainen transposoni, joka on liikkuva geneettinen elementti. Sitä esiintyy bakteereissa ja mahdollisesti laajemminkin, ja sen avulla antibioottiresistenssi voi siirtyä nopeasti eteenpäin.
K: Missä integroneita tyypillisesti esiintyy?
V: Integroneja esiintyy tyypillisesti plasmideissa ja kromosomeissa.
K: Mikä oli ensimmäinen integronien löydetty tehtävä?
V: Ensimmäinen integronien löydetty tehtävä oli antibioottiresistenssi.
K: Miten geenikasetit toimivat integronien kanssa?
V: Geenikasetteihin liittyy yleensä vain yksi geeni ja tietty rekombinaatiokohta. Ne kantavat antibioottiresistenssiä koodaavaa DNA:ta, joka koodaa entsyymiä, joka pilkkoo (leikkaa) antibioottimolekyylin. Integronin ensimmäinen osa sisältää geenin, joka koodaa entsyymiä kasettien sieppaamiseksi, kun taas toinen osa sisältää genomissa paikan, johon ne voidaan lisätä, sekä promoottorin, joka ohjaa kasettiin liittyvien geenien ilmentymistä.
K: Mitä tapahtuu, kun integronissa ei ole kasetteja?
V: Kun integronissa ei ole kasetteja, se kuvaa edelleen tällaisia rakenteita, vaikka niitä ei olisi integroitu siihen.
K: Voiko geenikasetteja leikata pois integronin sisältä?
V: Kyllä, geenikasetteja voidaan tarvittaessa leikata pois integronin sisältä.
K: Onko horisontaalinen geeninsiirto mahdollista integronien sisällä?
V: Kyllä, horisontaalinen geeninsiirto on mahdollista integronien sisällä niiden integroitujen geenikasettien avulla.