Biologinen luokittelu (taksonomia): lajien ryhmittely ja fylogenia
Biologinen luokittelu on biologien tapa ryhmitellä eliöitä. Luokittelun tavoitteena on järjestää eliöt järkeviksi kokonaisuuksiksi, selventää niiden sukulaisuussuhteita ja helpottaa tiedon hakemista, vertailua ja viestintää.
Historiallinen tausta
Luokittelu juontaa juurensa Aristoteleen työhön, joka kehitti aikanaan yksinkertaisia luokitteluperiaatteita. Merkittävä kehittäjä oli myös Carolus Linnaeus, joka 1700-luvulla toi käytäntöön systemaattisen binomisen nimistön: kaksiosaisen nimen, joka kertoo suvun ja lajin. Esimerkiksi ihmislajin nimi on Homo sapiens. Nykyisin linnaelainen nimistö on perusta lajien nimeämiselle, vaikka taksonomian periaatteet ovat ajan myötä monipuolistuneet.
Binominen nimistö ja nimistön käytäntöjä
Binominen nimi koostuu suvun nimestä ja lajinimikkeestä. Tavanomainen typografinen käytäntö on kirjoittaa suku- ja lajinnimet kursiivilla (esim. Homo sapiens) ja kirjoittaa suvun nimi isolla alkukirjaimella, lajinimi pienellä. Usein nimen perään lisätään taksonomin nimi tai nimenantovuosi (esim. Homo sapiens Linnaeus, 1758). Tieteellisellä nimistöllä on sääntönsä, joita ylläpitävät kansainväliset koodit (esim. International Code of Zoological Nomenclature, International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants).
Taksonomian periaatteet ja käsitteet
- Taksoni (mon. taksonit) tarkoittaa mitä tahansa luokkaa luokittelussa, esimerkiksi lajia, suku tai heimo (taksoniin).
- Tyypit ja holotyyppi: monet lajit on sidottu yksittäiseen näytteeseen (holotyyppi), joka toimii nimen määrittäjänä ja vertailun perustana.
- Synonyymit: saman lajin eri nimitykset voivat esiintyä vanhoissa julkaisuissa; taksonomiassa pyritään selkeyttämään oikeaa nimeä ja prioriteettia.
- Monofylia, parafylia ja polyfylia: nykyaikaisessa luokittelussa pyritään muodostamaan monofyletisiä ryhmiä, eli ryhmiä, jotka sisältävät kaikista yhteisestä esi-isästä polveutuvat jälkeläiset.
Luokkatasot (taksoneja koskevia esimerkkejä)
Perinteiset hierarkkiset tasot ovat esimerkiksi: domeeni (tai yli kunta), kunta, phyla (pääjako, eläimillä phylum), luokka, lahko (order), heimo (family), suku (genus) ja laji (species). Nykyisessä käytännössä jotkin ryhmät saattavat sisältää väliportaita kuten alataksa (subclass, superfamily jne.). Luokkatasot auttavat luomaan selkeitä, vertailtavia rakenteita, mutta ne eivät aina vastaa täydellisesti evolutiivisia suhteita.
Fylogenia ja nykyiset tutkimusmenetelmät
1900-luvun alkupuolelta lähtien luokittelun on yleensä oletettu perustuvan darwinistiseen yhteisen polveutumisen periaatteeseen (darwinistiseen). Nykyään käytetään laajasti molekyylidataa, erityisesti DNA-sekvenssianalyysiä, jonka perusteella voidaan rakentaa evoluutiopuita eli fylogeneettisiä puita. Tätä lähestymistapaa kutsutaan usein fylogenetiikaksi, ja se liittyy läheisesti kladismiin — tapaan hahmottaa taksonomian haarautumat kladeina.
Fylogeneettisissä analyyseissä käytetään erilaisia menetelmiä, kuten parsimoniaa, maksimitodennäköisyyttä (Maximum Likelihood) ja bayesilaista päättelyä. Aineistona voi olla morfologisia tunnuspiirteitä tai molekyylisiä merkkejä (esim. mitokondrion DNA, ydin-DNA, geeniperheet). Myös DNA-palkkikoodaus (DNA barcoding) on yleistynyt nopeana lajintunnistusmenetelmänä.
Taksonomian eri lähestymistavat
Taksonomiassa on ollut ja on edelleen erilaisia suuntauksia. Perinteinen morfologinen taksonomia perustuu ulkonäköön ja anatomiaan. Fylogeneettinen taksonomia pyrkii kuvaamaan evolutiivisia sukulaisuuksia ja suosii monofyletisiä ryhmiä. Fenetiikka korosti aiemmin kokonaissamankaltaisuutta ilman erityistä painotusta sukulaisuuteen, mutta se on vähentynyt molekyylimenetelmien myötä.
Lajien määrittely ja haasteet
Lajin käsitteen määrittely voi olla monimutkaista. Yleisiä lajikäsityksiä ovat esimerkiksi biologinen lajikonsepti (populaatiojoukko, joka voi lisääntyä keskenään luonnollisesti), morfologinen lajikäsitys (erot ulkonäössä) ja geneettiset rajat. Lisääntyminen, geeneissä tapahtuva eriytyminen, ekologinen eriytyminen ja käyttäytymiserot ovat tekijöitä, jotka otetaan huomioon. Taksonomit myös usein tekevät rajauksia uudelleen, kun uutta tietoa tulee saataville (esim. kryptisten lajien paljastuminen DNA:n avulla).
Käytännön merkitys
Hyvä taksonomia on tärkeää monilla aloilla: biologinen tutkimus, luonnonsuojelu, ekologia, maatalous, lääketiede ja ympäristöhallinto. Lajien ja ryhmien selkeä tunnistus auttaa esimerkiksi suojelutoimien kohdentamisessa, vieraslajien tunnistamisessa sekä sairauksien ja niiden kantajien seurantaan liittyvässä työssä.
Yhteenveto
Biologinen luokittelu eli taksonomia on sekä käytännöllinen työkalu että tieteellinen ala, joka yhdistää historiallisia menetelmiä ja moderneja molekyylitekniikoita. Nykyisin pyritään yhä enemmän rakentamaan luokittelua, joka heijastaa todellisia evolutiivisia suhteita — tätä lähestymistapaa edustavat mm. evoluutiopuut ja kladismi. Joskus samaan ryhmään (taksoniin) sijoitetut organismit ovat samankaltaisia; tällainen samankaltaisuus ei välttämättä ole sattumaa, vaan voi kertoa yhteisestä esi-isästä (esi-isästä) ja yhteisestä polveutumisesta.


Tärkeiden asemien hierarkia
Homologia
Homologiset piirteet ovat yhteisen esi-isän aiheuttamia samankaltaisuuksia. Ne eroavat ominaisuuksista, jotka ovat analogisia. Esimerkiksi linnuilla ja lepakoilla on molemmilla lentokyky, mutta sitä ei käytetä niiden luokitteluun, koska se ei ole periytynyt yhteisestä esi-isästä.
Kaikista muista eroavaisuuksista huolimatta se, että sekä lepakot että valaat ruokkivat poikasensa maidolla, on yksi niistä piirteistä, joiden perusteella molemmat luokitellaan nisäkkäiksi, koska se on periytynyt yhteisestä esi-isästä.
Kun nykyinen elävien olentojen nimeämisjärjestelmä kehitettiin, latinaa käytettiin eniten eri puolilla maailmaa. Niinpä tällaiset nimet ovat edelleen latinankielisiä. Myös uusien taksonien viralliset kuvaukset ja diagnoosit kirjoitettiin ja kirjoitetaan latinaksi. Eläinten kuvailuun eläintieteilijät sallivat minkä tahansa kielen. Tammikuun 1. päivästä 2012 alkaen levien, sienten ja kasvien uudet taksonit voidaan kuvata joko englanniksi tai latinaksi.
Nimien päättymiset
Suvun tason yläpuolella oleville taksoneille annetaan usein nimi, joka perustuu "tyyppisukuun" ja johon liitetään vakiomuotoinen jälkiliite. Näiden nimien muodostamisessa käytetyt päätteet riippuvat valtakunnasta ja joskus myös heimosta ja luokasta, kuten jäljempänä olevassa taulukossa esitetään.
Sijoitus | Levät | |||
Divisioona/heimo | -phyta | -mycota | ||
Osa-alue/alaryhmä | -phytina | -mycotina | ||
Luokka | -opsida | -phyceae | -mycetes | |
Alaluokka | -idae [sic] | -phycidae | -mycetidae | |
Superorder | -anae | |||
Tilaa | -ales | |||
Alajärjestys | -ineae | |||
Infrajärjestys | -aria | |||
Superfamily | -acea | -oidea | ||
Perhe | -aceae | -idae [sic] | ||
Alaperhe | -oideae | -inae | ||
Heimo/Sukuperhe | -eae | -ini | ||
Alaheimo | -inae | -ina |
Aiheeseen liittyvät sivut
- Binomial-nimikkeistö
- Taksonomia
- Systematiikka
- Kladistiikka
- Molekyylikehitys
- Molekyylikello
- Phylogeny
- Roskakori taksoni
- Evoluutioaste
Kysymyksiä ja vastauksia
Q: Mitä on biologinen luokittelu?
V: Biologinen luokittelu on tapa, jolla biologit ryhmittelevät eliöitä. Se tunnetaan myös nimellä taksonomia, ja siinä käytetään erilaisia periaatteita lajien luokittelemiseksi ryhmiin niiden yhteisten ominaisuuksien perusteella.
K: Kuka keksi moniluokkaisen luokittelujärjestelmän?
V: Moniluokkaisen luokittelujärjestelmän keksi Aristoteles.
K: Kuka popularisoi binomisen nimikkeistön idean?
V: Binomisen nimistön idean teki tunnetuksi Carolus Linnaeus, joka käytti kaksiosaista nimeä, jossa ilmoitettiin suku ja laji.
K: Miten lajien nimet yleensä painetaan?
V: Lajinimet painetaan yleensä kursiivilla, vaikka se ei olekaan pakollista (tämä koskee myös sukujen nimiä jne. jne.).
K: Millaiset tutkimukset ovat nykyään suosittuja molekyylievoluutiossa?
V: Molekyylievoluutiotutkimukset, joissa käytetään datana DNA-sekvenssianalyysiä, ovat nykyään suosittuja. Tällä lähestymistavalla luodaan usein evolutiivinen elämänpuu (biologia) ja käytetään merkkejä (ominaisuuksia) taksonomian haarojen päättämiseen.
K: Miksi samaan ryhmään sijoitetut eliöt voivat olla samankaltaisia?
V: Samaan ryhmään sijoitetut organismit voivat olla samankaltaisia pikemminkin yhteisen esi-isän yhteisen polveutumisen kuin sattuman vuoksi.