Pithovirus
Pithovirus on jättiläisvirusten suku, joka tarttuu ameeboihin. Se on kaksijuosteinen DNA-virus, ja se kuuluu suurten DNA-virusten kladiin. Se kuvattiin ensimmäisen kerran vuonna 2014, kun elinkelpoinen yksilö löydettiin 30 000 vuotta vanhasta jääytimestä, joka oli kerätty ikiroudasta Siperiassa, Venäjällä.
Se on kooltaan 50 prosenttia suurempi kuin edelliset suurimmat tunnetut virukset, mutta Pandoravirus on suurin virusgenomi, joka sisältää 1,9-2,5 megatavua DNA:ta. Pithoviruksella on paksu, soikea seinämä, jonka toisessa päässä on aukko. Sisäisesti sen rakenne muistuttaa hunajakennoa.
Sen genomi
Pithoviruksen genomissa on 467 erilaista geeniä, mikä on enemmän kuin tavallisella viruksella mutta paljon vähemmän kuin pandoraviruksella. Sen genomi on paljon vähemmän tiheä kuin minkään muun tunnetun viruksen. Kaksi kolmasosaa sen proteiineista ei ole samanlaisia kuin muilla viruksilla. Huolimatta fyysisestä samankaltaisuudesta Pandoraviruksen kanssa Pithoviruksen genomisekvenssi osoittaa, että se on tuskin sukua Pandoravirukselle. Se muistuttaa enemmän joidenkin muiden virusperheiden jäseniä. Nämä perheet sisältävät kaikki isoja ikonosaedrisiä viruksia, joilla on DNA-genomi. Pithoviruksen genomissa on 36 prosenttia GC-pitoisuutta, joka on samankaltainen kuin Megaviridae-heimon genomissa, kun taas pandoravirusten GC-pitoisuus on yli 61 prosenttia.
Replikointi
Pithoviruksen genomi on yksi pyöreä, kaksisäikeinen DNA-kromosomi (dsDNA), jossa on noin 610 000 emäsparia (bp). Sen DNA:sta muodostuu 467 eri proteiinia. Genomi koodaa kaikki mRNA:n tuottamiseen tarvittavat proteiinit; näitä proteiineja on puhdistetuissa virioneissa.
Pithovirus tekee koko replikaatiosyklinsä isäntänsä sytoplasmassa, eikä tyypillisimmin isännän ytimessä.
Discovery
Pithovirus sibericum löydettiin 30 000 vuotta vanhasta näytteestä Siperian ikiroudasta. Virus löydettiin hautautuneena 30 metriä pleistoseenin loppupuolen sedimentin pinnan alle. Se löydettiin, kun vuonna 2000 kerätyt jokivarren näytteet altistettiin ameeboille. Ameebat alkoivat kuolla ja niiden todettiin sisältävän jättiläisviruksia. Kirjoittajat kertoivat saaneensa idean tutkia ikiroudanäytteitä uusien virusten varalta luettuaan kokeesta, jossa samanlainen ikääntynyt siemen herätettiin henkiin kaksi vuotta aiemmin.
Vaikka virus on ihmiselle vaaraton, sen elinkelpoisuus vuosituhansia kestäneen jäädytyksen jälkeen herätti huolta siitä, että maailmanlaajuinen ilmastonmuutos ja tundran poraustoiminta voivat johtaa mahdollisesti vaarallisten virusten paljastumiseen. Toiset tutkijat kiistävät, että tämä olisi todellinen uhka.
