Yhteinen esi-isä (LUCA): elämän ja evoluution yhteinen alku
Tutustu LUCAan — viimeiseen yhteiseen esi-isään: elämän ja evoluution alku, 3,9 miljardia vuotta, tieteellinen näyttö ja merkitys nykylajeille.
Evoluutiobiologiassa eliöryhmällä on yhteinen syntyperä, jos niillä on yhteinen esi-isä. On olemassa vahvaa tukea teorialle, jonka mukaan kaikki maapallon elävät organismit polveutuvat yhteisestä esi-isästä.
Charles Darwin esitti teorian yleismaailmallisesta yhteisestä polveutumisesta evoluutioprosessin kautta teoksessaan Lajien synty sanomalla: "Tässä näkemyksessä, jonka mukaan elämä eri voimineen on alun perin hengitetty muutamaan muotoon tai yhteen muotoon, on jotain mahtavaa".p490
Viimeinen yleinen esi-isä (LUA) (tai viimeinen yleinen yhteinen esi-isä, LUCA) on kaikkien nykyisin elävien organismien viimeisin yhteinen esi-isä. Sen uskotaan ilmestyneen noin 3,9 miljardia vuotta sitten.
Mitä LUCA tarkoittaa käytännössä?
LUCA ei välttämättä tarkoita yhtä yksittäistä ensimmäistä elävää solua, vaan viimeistä yhteistä solulinjaa (tai populaatiota), josta nykyiset elämän haarat (bakteerit, arkeonit ja eukaryootit) polveutuvat. Se on siis viimeinen yhteinen esi-isä kaikille nykyisille eliöille — ei välttämättä "elämän alku" tai ensimmäinen itseään kopioiva järjestelmä. Monet varhaisemmista elämänmuodoista ovat voineet kuolla sukupuuttoon ilman jälkeläisiä, joten LUCA edustaa sitä haarautumispistettä, josta nykyiset taksonit juontavat juurensa.
Todisteet ja menetelmät LUCA:n rekonstruoimiseksi
LUCA:sta saadaan tietoa pääasiassa vertailevan genetiikan ja systeemibiologian kautta. Tärkeitä lähestymistapoja ovat:
- Vertailu- ja fylogeneettinen analyysi: tutkitaan kaikkien kolmen elämänalat ryhmien (bakteerit, arkeonit, eukaryootit) genomin yhteisiä geenejä ja rakennetaan evolutiivisia puuja.
- Konservoituneiden geenien tunnistus: esimerkiksi ribosomaaliset proteiinit ja translational taakka ovat erittäin säilyneitä, mikä viittaa niiden esiintyneen LUCA:ssa.
- Ancestral sequence reconstruction: tilastolliset menetelmät ennustavat alkuperäisiä (esi-alkuperäisiä) sekvenssejä ja proteiineja.
- Geokemialliset ja fossiiliset todisteet: varhaisimmat stromatoliitit, isotooppijäljet ja sedimenttifossiilit antavat aikarajauksen elämän olemassaololle maan varhaisessa historiassa.
Mitä LUCA mahdollisesti osasi ja millainen se oli?
Tutkimukset viittaavat siihen, että LUCA oli biokemiallisesti jo varsin kehittynyt verrattuna hyvin primitiivisiin hypoteettisiin elämänmuotoihin. Ominaisuuksia, joita usein mainitaan, ovat:
- geneettinen informaatiojärjestelmä (DNA tai DNA:ta jäljittelevä järjestelmä), mRNA ja ribosomit
- käänteinen ja eteenpäin suuntautunut translaatiomekanismi (proteiinisynteesi)
- perusmetabolisia reittejä — tutkimukset ehdottavat muun muassa energiantuottoa, joka voisi perustua kemolitotrofiaan (esim. vetyä ja hiilidioksidia käyttäviin reitteihin) ja yhden hiilen aineenvaihduntaan
- solukalvo tai jokin membranomainen rakenne, vaikka tarkka lipidityyppi saattaa poiketa nykyisten bakteerien ja arkeonien lipideistä
Monet paleobiologit ja molekyylibiologit ovat ehdottaneet, että LUCA eli anaerobisessa ympäristössä, mahdollisesti kuumissa ja kemiallisesti aktiivisissa olosuhteissa kuten merenalaisissa hydrotermisissa lähteissä tai geotermisissa ympäristöissä. Tällaisten ympäristöjen olosuhteet tukisivat kemolitotrofista energianottoa ja abioottista orgaanisten molekyylien syntyä.
Kuinka varmoja arviot ovat — rajoitukset ja kiistat
LUCA:n rekonstruointi kohtaa useita haasteita:
- Horisontaalinen geeninsiirto (HGT) on yleistä bakteerien ja arkeonien välillä. HGT vaikeuttaa evolutiivisten suhteiden selvittämistä ja voi peittää alleen perinteisen puumallin signaalin.
- Lähteiden katoaminen: monet varhaiset linjat ovat kuolleet sukupuuttoon, joten jäljellä oleva perimä edustaa vain tiettyä osajoukkoa alkuperäisestä geneettisestä monimuotoisuudesta.
- Ei suoraa fossiilia LUCA:sta: varhaisen elämän geokemialliset merkit antavat aikajanan mutta eivät yksilöllistä morfologista todistetta LUCA:sta.
- Teoreettiset erot: tutkijat kiistelevät siitä, oliko LUCA suhteellisen monimutkainen solu vai yksinkertaisempi, monien solujen ja geenien vaihdellessa muodostama metapopulaatio.
Miksi LUCA on tärkeä käsite?
LUCA yhdistää biologian evoluution historiaan ja auttaa ymmärtämään, millaiset perusbiokemialliset rakenteet ja reitit ovat olleet välttämättömiä elämän menestykselle. LUCA-tutkimus tarjoaa myös näkökulmia elämän synnyn tutkimukseen (kuten RNA-maailma -hypoteesi) ja siihen, mitä piirteitä etsiä etsiessä mahdollisia elämän merkkejä muilta planeetoilta.
Yhteenvetona: LUCA on tutkimuksellinen käsite, joka kuvaa viimeistä yhteistä kantaa kaikille nykyisille eliöille. Vaikka se ei välttämättä ollut ensimmäinen elämänmuoto, sen tutkimus paljastaa paljon siitä, kuinka varhaiset biokemialliset järjestelmät kehittyivät ja millaiset piirteet ovat universaaleja elämän kannalta.
Historia
Pierre-Louis Maupertuis esitti 1740-luvulla ensimmäisen tunnetun ehdotuksen siitä, että kaikilla eliöillä on voinut olla yhteinen esi-isä ja että ne ovat eronneet toisistaan satunnaisen vaihtelun ja olemassaolosta käytävän taistelun kautta. Essai de Cosmologie -teoksessaan Maupertuis totesi:
Eikö voisi sanoa, että koska luonnon tuotteiden sattumanvaraisissa yhdistelmissä on oltava sellaisia, joille on ominaista tietty soveltuvuussuhde ja jotka pystyvät säilymään, ei ole ihme, että tämä soveltuvuus on läsnä kaikissa nykyisin olemassa olevissa lajeissa? Sattuma, voisi sanoa, on tuottanut lukemattoman määrän yksilöitä; pieni osa niistä on rakentunut siten, että eläimen osat pystyvät tyydyttämään sen tarpeet; toisessa, äärettömän suuressa osassa ei ole sopivuutta eikä järjestystä: kaikki nämä jälkimmäiset ovat tuhoutuneet... Nykyisin näkemämme lajit ovat vain pienin osa siitä, mitä sokea kohtalo on tuottanut...
Todisteet universaalista yhteisestä polveutumisesta
Yhteinen biokemia ja geneettinen koodi
Kaikki tunnetut elämänmuodot perustuvat samaan biokemialliseen perusorganisaatioon.
Geneettinen informaatio koodataan DNA:han ja transkriboidaan RNA:ksi, jonka jälkeen (hyvin samankaltaiset) ribosomit kääntävät sen proteiineiksi ATP:n, NADH:n ja muiden energialähteiden avulla jne.
Samankaltaisuuksia ovat muun muassa energiankantaja adenosiinitrifosfaatti (ATP) ja se, että kaikki proteiineissa esiintyvät aminohapot ovat vasenkätisiä (kiraalisuus).
Lisäksi geneettinen koodi ("käännöstaulukko", jonka mukaan DNA-informaatio muunnetaan proteiineiksi) on lähes identtinen kaikissa tunnetuissa elämänmuodoissa bakteereista ihmisiin.
Biologit pitävät tämän koodin yleismaailmallisuutta yleensä lopullisena todisteena universaalin yhteisen polveutumisen teorian puolesta. Myös geneettisen koodin pienten erojen analyysi on antanut tukea universaalille yhteiselle polveutumiselle. Erilaisten vaihtoehtoisten hypoteesien tilastollinen vertailu on osoittanut, että universaali yhteinen syntyperä on huomattavasti todennäköisempi kuin mallit, joihin liittyy useita alkuperiä.
Fylogeneettiset puut
Toinen tärkeä todiste on se, että on mahdollista rakentaa yksityiskohtaisia fylogeneettisiä puita (eli lajien "sukupuita"), joissa kartoitetaan kaikkien elävien lajien ehdotetut jaot ja yhteiset esivanhemmat. Vuonna 2010 tehty analyysi saatavilla olevista geneettisistä tiedoista, jotka kartoitettiin fylogeneettisiin puihin, antoi "vankkaa kvantitatiivista tukea elämän yhtenäisyydelle". ...elämän yhtenäisyydelle on nyt vahvaa kvantitatiivista tukea muodollisen testin avulla.
Perinteisesti nämä puut on rakennettu morfologisin menetelmin, kuten vertailevan anatomian ja embryologian avulla. Viime aikoina näitä puita on voitu rakentaa molekyylitietojen avulla, jotka perustuvat geneettisten ja proteiinisekvenssien välisiin yhtäläisyyksiin ja eroihin. Kaikki nämä menetelmät tuottavat pääosin samanlaisia tuloksia. Se, että erityyppisiin tietoihin perustuvat fylogeneettiset puut ovat yhtäpitäviä keskenään, on vahva todiste taustalla olevasta yhteisestä polveutumisesta.
Viimeinen yleinen yhteinen esi-isä
Joitakin asioita on päätelty LUCA:sta tai LUA:sta. Se ei ollut ensimmäinen solu, vaan solu, jonka jälkeläiset selviytyivät mikrobien evoluution varhaisimpia vaiheita pidemmälle. Sen perusteella, että niitä esiintyi eubakteereissa, arkeoissa ja eukaryooteissa, LUCA:ssa oli noin 325 proteiinia.
Nämä aminohapot olivat todennäköisesti ensimmäiset, jotka rakennettiin proteiineihin: alaniini, asparagiini, asparagiinihappo, glysiini, histidiini, isoleusiini, seriini, treoniini ja valiini. Näitä aminohappoja löydettiin myös kipinätuubisimulaatioissa ja Murchisonin meteoriitin analyysissä. Muut aminohapot, jotka on lisätty geneettiseen koodiin myöhemmin, sisältävät useita monimutkaisimpia aminohappoja.
Vuosina 2000-2018 tehdyt tutkimukset ovat viitanneet LUCA:n yhä muinaisempaan aikaan. Vuonna 2000 arvioiden mukaan LUCA oli olemassa 3,5-3,8 miljardia vuotta sitten paleoarkean aikakaudella, muutama sata miljoonaa vuotta ennen varhaisimpia fossiilisia todisteita elämästä, jolle on useita ehdokkaita, joiden ikä vaihtelee 3,48-4,28 miljardin vuoden välillä.
Bristolin yliopiston vuonna 2018 tekemässä tutkimuksessa, jossa käytettiin molekyylikellomallia, LUCA sijoittuu hieman 4,5 miljardin vuoden taakse, Hadean-kaudelle.
Kysymyksiä ja vastauksia
K: Mitä on evoluutiobiologia?
A: Evoluutiobiologia on tutkimus siitä, miten elävät organismit ovat kehittyneet ajan kuluessa ja miten ne ovat yhteydessä toisiinsa.
K: Mitä Charles Darwin ehdotti kirjassaan Lajien synty?
V: Charles Darwin esitti teoksessaan On the Origin of Species (Lajien synty) teorian yleismaailmallisesta yhteisestä polveutumisesta evoluutioprosessin kautta. Hän uskoi, että kaikki elävät organismit maapallolla polveutuvat yhteisestä esi-isästä.
K: Mikä on viimeinen yleinen esi-isä (LUA)?
V: Viimeinen yleinen esi-isä (LUA), joka tunnetaan myös nimellä viimeinen yleinen yhteinen esi-isä (LUCA), on kaikkien nykyisin elävien organismien viimeisin yhteinen esi-isä. Sen uskotaan ilmestyneen noin 3,9 miljardia vuotta sitten.
Kysymys: Miten evoluutiobiologia tukee Charles Darwinin teoriaa?
V: Evoluutiobiologia tukee Charles Darwinin teoriaa tarjoamalla todisteita siitä, että kaikki maapallon elävät organismit polveutuvat yhteisestä esi-isästä ja että tämä prosessi on tapahtunut evoluutioprosessin kautta ajan kuluessa. Tämä antaa vahvan tuen hänen hypoteesilleen.
Kysymys: Mitä tarkoittaa, kun organismiryhmällä on "yhteinen syntyperä"?
V: Kun eliöryhmällä on "yhteinen syntyperä", se tarkoittaa, että niillä on yksi yhteinen esi-isä jossain vaiheessa evoluutiota. Tämä viittaa siihen, että nämä lajit ovat jollakin tavalla sukua toisilleen ja että ne voivat jäljittää esi-isänsä yhteen lähtöorganismiin tai -lajiin.
Kysymys: Miten Charles Darwin kuvasi näkemystään elämästä?
V: Charles Darwin kuvaili näkemystään elämästä "mahtavaksi" sanomalla: "Tässä näkemyksessä elämästä ja sen monista voimista, jotka on alun perin puhallettu muutamaan muotoon tai yhteen muotoon, on mahtavuutta."
Etsiä