Molekyylisymmetria
Molekyylisymmetria on kemian perusajatus. Kyse on molekyylien symmetriasta. Se jakaa molekyylit ryhmiin niiden symmetrian mukaan. Se voi ennustaa tai selittää monia molekyylin kemiallisia ominaisuuksia.
Kemistit tutkivat symmetriaa selittääkseen, miten kiteet rakentuvat ja miten kemikaalit reagoivat. Reagenssien molekyylisymmetria auttaa ennustamaan, miten reaktiotuote muodostuu ja kuinka paljon energiaa reaktioon tarvitaan.
Molekyylin symmetriaa voidaan tutkia useilla eri tavoilla. Ryhmäteoria on suosituin ajatus. Ryhmäteoria on hyödyllinen myös molekyyliorbitaalien symmetrian tutkimisessa. Sitä käytetään Hückelin menetelmässä, ligandikenttäteoriassa ja Woodward-Hoffmannin säännöissä. Toinen laajemmassa mittakaavassa oleva ajatus on kidejärjestelmien käyttö kiteellisen symmetrian kuvaamiseen bulkkimateriaaleissa.
Tutkijat löytävät molekyylin symmetrian röntgenkristallografian ja muiden spektroskopian muotojen avulla. Spektroskooppinen merkintätapa perustuu molekyylisymmetriasta saatuihin tietoihin.
Historiallinen tausta
Fyysikko Hans Bethe käytti pisteryhmäoperaatioiden hahmoja ligandikenttäteorian tutkimuksessaan vuonna 1929. Eugene Wigner käytti ryhmäteoriaa selittääkseen atomispektroskopian valintasääntöjä. Ensimmäiset merkkitaulukot kokosi László Tisza (1933) värähtelyspektrien yhteydessä. Robert Mulliken julkaisi merkkitaulukot ensimmäisenä englanniksi (1933). E. Bright Wilson käytti niitä vuonna 1934 ennustamaan värähtelyn normaalimoodien symmetriaa. Rosenthal ja Murphy julkaisivat vuonna 1936 täydellisen 32 kiteisen pisteryhmän sarjan.
Symmetrian käsitteet
Matemaattista ryhmäteoriaa on sovellettu molekyylien symmetrian tutkimiseen.
Elementit
Molekyylin symmetriaa voidaan kuvata 5 erityyppisellä symmetriaelementillä.
- Symmetria-akseli: akseli, jonka ympäri 360 ∘ n {\displaystyle {\tfrac {360^{{\circ }}{n}}} kiertäminen johtaa molekyyliin, joka näyttää identtiseltä molekyylin kanssa ennen kiertämistä. Tätä kutsutaan myös n-kertaiseksi kiertoakseliksi ja lyhennetään Cn. Esimerkkejä ovat C2 vedessä ja C3 ammoniakissa. Molekyylillä voi olla useampi kuin yksi symmetria-akseli; sitä, jonka n-kertaisuus on suurin, kutsutaan pääakseliksi, ja tavan mukaan sille annetaan z-akseli kartesiankoordinaatistossa.
- Symmetriataso: heijastustaso, jonka kautta saadaan identtinen kopio alkuperäisestä molekyylistä. Tätä kutsutaan myös peilitasoksi ja lyhennetään σ. Vedessä on kaksi tällaista tasoa: yksi molekyylin itsensä tasossa ja yksi kohtisuorassa (suorassa kulmassa) siihen nähden. Pääakselin suuntaista symmetriatasoa kutsutaan pystyakseliksi (σv) ja siihen nähden kohtisuoraa vaakatasoksi (σh). On olemassa myös kolmannen tyyppinen symmetriataso: jos pystysuora symmetriataso lisäksi puolittaa kahden pääakseliin nähden kohtisuorassa olevan 2-kertaisen kiertoakselin välisen kulman, tasoa nimitetään dihedriseksi (σd). Symmetriataso voidaan tunnistaa myös sen karteesisesta orientaatiosta, esim. (xz) tai (yz).
- Symmetriakeskus tai inversiokeskus, lyhennettynä i. Molekyylillä on symmetriakeskus, kun molekyylin minkä tahansa atomin kohdalla on identtinen atomi, joka on vastapäätä keskusta yhtä kaukana siitä. Keskuksessa voi olla atomi tai ei. Esimerkkejä ovat ksenontetrafluoridi (XeF4), jossa inversiokeskus on Xe-atomissa, ja bentseeni (C6H6), jossa inversiokeskus on renkaan keskellä.
- Kiertoheijastusakseli: akseli, jonka ympäri 360 ∘ n {\displaystyle {\tfrac {360^{{\circ }}{n}}}} , jota seuraa heijastus siihen kohtisuorassa olevaan tasoon, jättää molekyylin ennalleen. Sitä kutsutaan myös n-kertaiseksi epäsäännölliseksi kiertoakseliksi, ja se lyhennetään Sn:ksi, jolloin n on välttämättä parillinen. Esimerkkejä on tetraedrisessä piitetrafluoridissa, jossa on kolme S4-akselia, ja etaanin porrastetussa konformaatiossa, jossa on yksi S6-akseli.
- Identiteetti (myös E), saksan kielen sanasta 'Einheit', joka tarkoittaa yhtenäisyyttä. Sitä kutsutaan "Identiteetiksi", koska se on kuin numero yksi (ykseys) kertolaskussa. (Kun luku kerrotaan ykkösellä, vastaus on alkuperäinen luku.) Tämä symmetriaelementti tarkoittaa, että mikään ei muutu. Jokaisessa molekyylissä on tämä elementti. Identtinen symmetriaelementti auttaa kemistejä käyttämään matemaattista ryhmäteoriaa.
Toiminta
Jokaisella viidellä symmetriaelementillä on symmetriaoperaatio. Symmetriaelementin sijasta puhutaan operaatiosta karetilla (^). Ĉn on siis molekyylin kierto akselin ympäri ja Ê on identiteettioperaatio. Symmetriaelementtiin voi liittyä useampi kuin yksi symmetriaoperaatio. Koska C1 vastaa E:tä, S1 vastaa σ:tä ja S2 vastaa i:tä, kaikki symmetriaoperaatiot voidaan luokitella joko oikeiksi tai epäsäännöllisiksi kiertoiksi.
Vesimolekyyli on symmetrinen
Bentseeni
Pisteryhmät
Pisteryhmä on joukko symmetriaoperaatioita, jotka muodostavat matemaattisen ryhmän, jossa vähintään yksi piste pysyy kiinteänä kaikissa ryhmän operaatioissa. Kiteinen pisteryhmä on pisteryhmä, joka toimii translaatiosymmetrian kanssa kolmiulotteisesti. Kiteellisiä pisteryhmiä on yhteensä 32, joista 30 on kemian kannalta merkityksellisiä. Tutkijat käyttävät Schoenfliesin merkintätapaa pisteryhmien luokitteluun.
Ryhmäteoria
Matematiikka määrittelee ryhmän. Joukko symmetriaoperaatioita muodostaa ryhmän, kun:
- minkä tahansa kahden operaation peräkkäisen soveltamisen (komposition) tulos on myös ryhmän jäsen (sulkeuma).
- operaatioiden soveltaminen on assosiatiivista: A(BC) = (AB)C
- ryhmässä on identiteetti-operaatio, jota merkitään E, jolloin AE = EA = A mille tahansa ryhmän operaatiolle A.
- Jokaiselle operaatiolle A ryhmässä on olemassa käänteinen alkio A-1 ryhmässä, jolle AA-1 = A-1A = E
Ryhmän järjestys on kyseisen ryhmän symmetriaoperaatioiden lukumäärä.
Esimerkiksi vesimolekyylin pisteryhmä on C2v, ja symmetriaoperaatiot ovat E, C2, σv ja σv'. Sen järjestys on siis 4. Kukin operaatio on oma käänteisoperaationsa. Esimerkkinä sulkeutumisesta voidaan todeta, että C2-rotaatio, jota seuraa σv-heijastus, on σv'-symmetriaoperaatio: σv*C2 = σv'. (Huomaa, että "operaatio A, jota seuraa B muodostaen C" kirjoitetaan BA = C).
Toinen esimerkki on ammoniakkimolekyyli, joka on pyramidinmuotoinen ja jossa on kolminkertainen kiertoakseli sekä kolme peilitasoa, jotka ovat 120°:n kulmassa toisiinsa nähden. Jokainen peilitaso sisältää N-H-sidoksen ja puolittaa H-N-H-sidoksen kulman, joka on vastakkainen kyseiselle sidokselle. Ammoniakkimolekyyli kuuluu siis C3v-pistemolekyyliryhmään, jonka järjestys on 6: identtinen elementti E, kaksi kiertooperaatiota C3 ja C32 sekä kolme peiliheijastumaa σv, σv' ja σv".
Yhteiset pääryhmät
Seuraavassa taulukossa on luettelo pääryhmistä ja edustavista molekyyleistä. Rakennekuvaus sisältää VSEPR-teoriaan perustuvat molekyylien yleiset muodot.
Pisteryhmä | Symmetriaelementit | Yksinkertainen kuvaus, tarvittaessa kiraalinen | Havainnollistavat lajit |
C1 | E | ei symmetriaa, kiraalinen | CFClBrH, lysergihappo |
Cs | E σh | tasomainen, ei muuta symmetriaa | tionyylikloridi, hypokloorihappo |
Ci | E i | Inversiokeskus | anti-1,2-dikloori-1,2-dibromietaani |
C∞v | E 2C∞ σv | lineaarinen | vetykloridi, hiilimonoksidi |
D∞h | E 2C∞ ∞σi i 2S∞ ∞C2 | lineaarinen inversiokeskuksen kanssa | dihydroksi, atsidi-anioni, hiilidioksidi |
C2 | E C2 | "avoimen kirjan geometria", kiraalinen geometria. | vetyperoksidi |
C3 | E C3 | potkuri, kiraalinen | trifenyylifosfiini |
C2h | E C2 i σh | tasomainen, jossa on inversiokeskus | trans-1,2-dikloorieteeni |
C3h | E C3 C32 σh S3 S35 | potkuri | Boorihappo |
C2v | E C2 σv(xz) σv'(yz) | kulmikas (H2O) tai sirkkelimäinen (SF4). | vesi, rikkitetrafluoridi, rikkifluoridi, sulfuryylifluoridi |
C3v | E 2C3 3σv | trigonuspyramidin muotoinen | ammoniakki, fosforioksikloridi |
C4v | E 2C4 C2 2σv 2σd | neliöpyramidin muotoinen | ksenon-oksitetrafluoridi |
D2 | E C2(x) C2(y) C2(z) C2(z) | kierre, kiraali | sykloheksaanin kierrekonformaatio |
D3 | E C3(z) 3C2 | kolmoiskierre, kiraalinen | Tris(etyleenidiamiini)koboltti(III)kationi |
D2h | E C2(z) C2(y) C2(x) i σ(xy) σ(xz) σ(yz) σ(yz) | tasomainen, jossa on inversiokeskus | etyleeni, dityppitetroksidi, diboraani |
D3h | E 2C3 3C2 σh 2S3 3σv | trigonaalinen tasomainen tai trigonaalinen kaksoispyramidaali | booritrifluoridi, fosforipentakloridi |
D4h | E 2C4 C2 2C2 C2 2C2' 2C2 i 2S4 σh 2σv 2σd | neliön muotoinen tasomainen | ksenontetrafluoridi |
D5h | E 2C5 2C52 5C2 σh 2S5 2S53 5σv | viisikulmainen | rutenoseeni, pimenevä ferroseeni, C70-fullereeni |
D6h | E 2C6 2C3 C2 3C2' 3C2 i 3S3 2S63 σh 3σd 3σv | kuusikulmainen | bentseeni, bis(bentseeni)kromi |
D2d | E 2S4 C2 2C2' 2σd | 90° kierre | alleeni, tetra-rikkitetrannitridi |
D3d | E C3 3C2 i 2S6 3σd E C3 3C2 i 2S6 3σd | 60° kierre | etaani (porrastettu rotameri), sykloheksaanin tuolikonformaatio |
D4d | E 2S8 2C4 2S83 C2 4C2' 4σd | 45° kierre | dimangaanidekakarbonyyli (porrastettu rotameri) |
D5d | E 2C5 2C52 5C2 i 3S103 2S10 5σd | 36° kierre | ferroseeni (porrastettu rotameri) |
Td | E 8C3 3C2 6S4 6σd | tetraedrinen | metaani, fosforipentoksidi, adamantaani |
Oh | E 8C3 6C2 6C4 3C2 i 6S4 8S6 3σh 6σd | oktaedrinen tai kuutiomainen | kubaani, rikkiheksafluoridi |
Ih | E 12C5 12C52 20C3 15C2 i 12S10 12S103 20S6 15σ | icosahedral | C60, B12H122- |
Edustukset
Symmetriaoperaatiot voidaan kirjoittaa monella tavalla. Hyvä tapa kirjoittaa ne on käyttää matriiseja. Jos jokin vektori edustaa kartesiankoordinaatistossa olevaa pistettä, se kerrotaan vasemmalle ja saadaan symmetriaoperaatiolla muutetun pisteen uusi paikka. Operaatioiden kompositio tehdään matriisikertoimella. Esimerkissä C2v tämä on:
[ - 1 0 0 0 - 1 0 0 0 0 1 ] ⏟ C 2 × [ 1 0 0 0 - 1 0 0 0 0 1 ] ⏟ σ v = [ - 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 ] ⏟ σ v ′ {\displaystyle \underbrace {\begin{bmatrix}-1&0&0\\0&-1&0\\0&0&1\\\end{bmatrix}} _{C_{2}}\times \underbrace {\begin{bmatrix}1&0&0\\0&-1&0\\0&0&1\\\end{bmatrix}} _{\sigma _{v}}=\underbrace {\begin{bmatrix}-1&0&0\\0&1&0\\0&0&1\\\end{bmatrix}} _{\sigma '_{v}}}
Vaikka tällaisia esityksiä (tapoja esittää asioita) on olemassa ääretön (ikuisesti jatkuva) määrä, käytetään yleisesti ryhmän redusoitumattomia esityksiä (tai "irreppejä"), koska kaikki muut ryhmän esitykset voidaan kuvata redusoitumattomien esitysten lineaarikombinaationa. (Irrepit kattavat symmetriaoperaatioiden vektoriavaruuden.) Kemistit käyttävät irreppejä symmetriaryhmien lajitteluun ja niiden ominaisuuksista puhumiseen.
Merkkitaulukot
Kunkin pääryhmän osalta on hahmotaulukko, jossa on yhteenveto sen symmetriaoperaatioista ja irreduusoituvista esityksistä. Taulukot ovat neliönmuotoisia, koska redusoitumattomia esityksiä ja symmetriaoperaatioiden ryhmiä on aina yhtä monta.
Itse taulukko koostuu merkeistä, jotka osoittavat, miten tietty redusoimaton esitys muuttuu, kun siihen sovelletaan (asetetaan) tiettyä symmetriaoperaatiota. Mikä tahansa molekyylin pisteryhmään kohdistuva symmetriaoperaatio, joka vaikuttaa itse molekyyliin, jättää sen ennalleen. Mutta kun vaikutetaan yleiseen kokonaisuuteen (olioon), kuten vektoriin tai orbitaaliin, näin ei tarvitse tapahtua. Vektori voi muuttaa merkkiä tai suuntaa ja orbitaali voi muuttaa tyyppiä. Yksinkertaisten pisteryhmien arvot ovat joko 1 tai -1: 1 tarkoittaa, että (vektorin tai orbitaalin) merkki tai vaihe säilyy muuttumattomana symmetriaoperaatiossa (symmetrinen), ja -1 tarkoittaa merkin vaihtumista (epäsymmetrinen).
Esitykset merkitään tiettyjen konventioiden mukaisesti:
- A, kun kierto pääakselin ympäri on symmetrinen.
- B, kun kierto pääakselin ympäri on epäsymmetrinen.
- E ja T ovat kaksi- ja kolminkertaisesti degeneroituneita esityksiä.
- kun pisteryhmällä on inversiokeskipiste, alaviite g (saksaksi: gerade tai parillinen) tarkoittaa, että merkin merkki ei muutu, ja alaviite u (ungerade tai epätasainen) merkitsee merkin muutosta inversioon nähden.
- pisteryhmien C∞v ja D∞h kanssa symbolit on lainattu kulmamomentin kuvauksesta: Σ, Π, Δ.
Taulukoissa kerrotaan myös kartesiolaiset perusvektorit, niiden kiertymät ja niiden kvadraattiset funktiot, jotka on muunnettu ryhmän symmetriaoperaatioilla. Taulukosta nähdään myös, mikä irredusoituva esitys muuntuu samalla tavalla (taulukoiden oikealla puolella). Kemistit käyttävät tätä, koska kemiallisesti tärkeillä orbitaaleilla (erityisesti p- ja d-orbitaaleilla) on samat symmetriat kuin näillä olioilla.
C2v-symmetriapisteryhmän merkkitaulukko on esitetty jäljempänä:
C2v | E | C2 | σv(xz) | σv'(yz) | ||
A1 | 1 | 1 | 1 | 1 | z | x2, y2, z2 |
A2 | 1 | 1 | -1 | -1 | Rz | xy |
B1 | 1 | -1 | 1 | -1 | x, Ry | xz |
B2 | 1 | -1 | -1 | 1 | y, Rx | yz |
Esimerkiksi vesi (H2O), jolla on edellä kuvattu C2v-symmetria. Hapen 2px-orbitaali on suunnattu kohtisuoraan molekyylin tasoon nähden, ja se vaihtaa merkkiä C2- ja σv'(yz)-operaatiolla, mutta pysyy muuttumattomana kahdella muulla operaatiolla (identiteetti-operaation merkki on luonnollisesti aina +1). Tämän orbitaalin merkkijono on siis {1, -1, 1, -1}, mikä vastaa B1-redusoitumatonta esitystä. Vastaavasti 2pz-orbitaalilla nähdään olevan symmetria, joka vastaa irredesubstituoituvaa esitystä A1, 2py B2 ja 3dxy-orbitaalilla A2. Nämä ja muut määritykset ovat taulukon kahdessa oikeanpuoleisimmassa sarakkeessa.
Kysymyksiä ja vastauksia
K: Mitä on molekyylisymmetria?
V: Molekyylisymmetria on kemian käsite, joka kuvaa molekyylien symmetriaa ja jakaa ne ryhmiin niiden ominaisuuksien perusteella.
K: Miksi molekyylisymmetria on tärkeää kemiassa?
V: Molekyylisymmetria on tärkeää kemiassa, koska sen avulla voidaan ennustaa tai selittää monia molekyylin kemiallisia ominaisuuksia. Kemistit tutkivat symmetriaa selittääkseen, miten kiteet rakentuvat ja miten kemikaalit reagoivat.
K: Miten molekyylisymmetria auttaa ennustamaan kemiallisen reaktion tuotteen?
V: Reagenssien molekyylisymmetria voi auttaa ennustamaan, miten reaktiotuote muodostuu ja kuinka paljon energiaa reaktioon tarvitaan.
K: Mitä on ryhmäteoria kemiassa?
V: Ryhmäteoria on kemian alalla suosittu ajatus, jota käytetään molekyylien ja molekyyliorbitaalien symmetrian tutkimiseen. Sitä käytetään myös Hückelin menetelmässä, ligandikenttäteoriassa ja Woodward-Hoffmannin säännöissä.
Kysymys: Miten kidejärjestelmiä käytetään kuvaamaan kiteistä symmetriaa?
V: Kidejärjestelmiä käytetään kuvaamaan kiteistä symmetriaa bulkkimateriaaleissa. Niitä käytetään kuvaamaan atomien sijoittelua kideruudussa.
K: Miten tutkijat löytävät molekyylisymmetrian?
V: Tutkijat löytävät molekyylisymmetrian röntgenkristallografian ja muiden spektroskopian muotojen avulla. Spektroskooppinen merkintätapa perustuu molekyylisymmetriasta otettuihin tosiasioihin.
K: Miksi molekyylisymmetrian tutkiminen on tärkeää kemiallisten reaktioiden ymmärtämisessä?
V: Molekyylisymmetrian tutkiminen on tärkeää kemiallisten reaktioiden ymmärtämisessä, koska sillä voidaan ennustaa tai selittää monia molekyylin kemiallisia ominaisuuksia. Sillä voidaan myös ennustaa reaktion tuote ja reaktioon tarvittava energia.