Muhammad Ali Jinnah syntyi 25. joulukuuta 1876 Karachissa Poonja Jinnahin isma'ilistiseen perheeseen. Jinnah. Hän syntyi Jhirkissä, Sindhin kaupungissa. Hänen isänsä nimi oli Jinnah Poonja (1857- 1901) ja äitinsä nimi Mithibai. Jinnah oli vanhin Jinnah Poonjan ja Mithibain seitsemästä lapsesta. Hänen perheensä oli muuttanut Sindhiin Intian Gujaratin Kathiawarin alueelta.
Jinnahin syntymänimi oli Mahomedali Jinnahbhai. Myöhemmin hän muutti sen paljon yksinkertaisemmaksi nimeksi "Muhammad Ali Jinnah" eli M.A. Kotona hänen perheensä puhui gujaratinkielellä, ja lapset oppivat puhumaan myös kutchia ja englantia. Fatimaa lukuun ottamatta hänen sisaruksistaan tiedetään vain vähän.
Varhaiset työvuodet
Vuonna 1891 (ollessaan 15-vuotias) Jinnah lähti Lontooseen ja työskenteli muutaman vuoden eräässä yrityksessä. Samoihin aikoihin hänen äitinsä kuoli.
Vuonna 1894 Jinnah lopetti työnsä opiskellakseen oikeustiedettä. Hän osallistui Lincoln's Innin kurssille ja valmistui vuonna 1896. Vielä Lontoossa hän alkoi osallistua myös politiikkaan. Hän ihaili suuresti intialaisia poliittisia johtajia Dadabhai Naorojia ja Sir Pherozeshah Mhetaa. Vähitellen Jinnah kehitti omaa poliittista näkemystään. Hän ajatteli sillä linjalla, että Intialla pitäisi olla perustuslaillinen itsehallinto.
Samoihin aikoihin hänen isänsä menetti yrityksensä. Tämä aiheutti Jinnahille suuria vaikeuksia. Sillä välin hän oli alkanut harjoittaa asianajajan ammattia Mumbaissa. Hän myös rakensi talon Mumbain Malabar Hillin alueelle. Talo tunnetaan nykyään nimellä Jinnah House.
Hänestä tuli menestyvä asianajaja. Vuonna 1908 hän edusti Bal Gangadhar Tilakia, kuuluisaa Intian kansalliskongressin johtajaa. Tilakia syytettiin kapinasta Britannian hallintoa vastaan. Jinnah puolusti tapausta hyvin, mutta Tilak joutui vankilaan, minkä jälkeen hän menetti toivonsa.
Varhaiset vuodet poliitikkona
Jinnah oli liittynyt Intian kansalliskongressiin jo vuonna 1906, kun hän aloitti politiikassa. Kongressi oli Intian suurin poliittinen järjestö. Monet Intian kansalliskongressin jäsenet ja johtajat kannattivat Intian rajoitettua itsehallintoa. Myös Jinnah oli samaa mieltä. Hänen esikuvansa oli tuolloin Gopal Krishna Gokhale.
Tammikuun 25. päivänä 1910 Jinnahista tuli seitsemänkymmentäkaksijäsenisen keisarillisen lainsäädäntöneuvoston jäsen. Hän oli neuvoston aktiivinen jäsen. Kuten monet muutkin Intian johtajat, myös Jinnah tuki Isoa-Britanniaa ensimmäisen maailmansodan aikana. Johtajat olivat tukeneet Isoa-Britanniaa ajatellen, että sodan jälkeen Iso-Britannia myöntäisi Intialle poliittisen vapauden.
Aluksi Jinnah oli välttänyt liittymistä Intian poliittiseen järjestöön, All India Muslim Leagueen. Muslimit olivat perustaneet liiton vuonna 1906. Vuonna 1913 Jinnah liittyi Muslimiliiton jäseneksi. Vuonna 1934 hänestä tuli Muslimiliiton puheenjohtaja. Hän auttoi kongressin ja Muslimiliiton välisen sopimuksen tekemisessä (Lucknowin sopimus vuonna 1916). Sopimuksella pyrittiin esittämään yhtenäinen rintama briteille, jotta Intia saisi itsehallintoalueen aseman Brittiläisessä imperiumissa. Tämä oli samankaltainen kuin Kanadan, Uuden-Seelannin ja Australian dominion-status tuohon aikaan.
Vuonna 1918 Jinnah meni uudelleen naimisiin. Hänen toinen vaimonsa oli Rattanbai Petit. Hän oli kaksikymmentäneljä vuotta nuorempi kuin mies. Hän oli Jinnahin henkilökohtaisen ystävän Sir Dinshaw Petitin tytär, joka kuului parsi-zarathustralaisyhteisöön. Monet parsit ja muslimit eivät pitäneet kahden uskonnon edustajien välisistä avioliitoista. Pariskunta asui Bombayssa (nykyisessä Mumbaissa) ja matkusti usein Eurooppaan. Vuonna 1919 hänen vaimonsa synnytti tyttären, joka sai nimekseen Dina.
Vuoteen 1918 mennessä Mohandas Gandhista oli tullut yksi kongressipuolueen johtajista. Gandhi asettui väkivallattoman protestin linjalle Intian itsehallinnon saamiseksi. Jinnah omaksui toisenlaisen linjan. Hän halusi perustuslaillisen taistelun Intian itsehallinnon saavuttamiseksi. Jinnah vastusti myös Gandhin tukea khilafat-liikkeelle. Vähitellen heidän välilleen oli syntynyt monia erimielisyyksiä. Vuonna 1920 Jinnah erosi kongressipuolueesta. Hänestä tuli Muslimiliiton puheenjohtaja. Tuolloin Jinnah esitti ohjelman, jolla hän pyrki vähentämään kongressipuolueen ja Muslimiliiton välisiä erimielisyyksiä. Ohjelmassa oli neljätoista kohtaa. Siksi se tunnettiin kansanomaisesti nimellä Jinnahin neljätoista kohtaa. Kongressipuolue ei kuitenkaan hyväksynyt niitä.
Näiden vuosien aikana Jinnahin yksityiselämä oli kärsinyt. Hänen keskittymisensä politiikkaan oli johtanut jännitteisiin Jinnahin avioliitossa.Pariskunta erosi vuonna 1927, ja vakavan sairauden jälkeen Rattanbai kuoli.
Samoihin aikoihin pidettiin Intian johtajien ja Ison-Britannian hallituksen välinen konferenssi. Se pidettiin Lontoossa, ja se tunnetaan nimellä pyöreän pöydän konferenssi. Jinnah kritisoi Gandhin politiikkaa. Konferenssi epäonnistui. Jinnah ei ollut tyytyväinen myöskään Muslimiliittoon. Hän päätti lopettaa politiikan. Hän ryhtyi jälleen työskentelemään asianajajana Englannissa. Kaikkina näinä vuosina hänen sisarensa Fatima Jinnah huolehti Jinnahin asioista sekä kotona että sen ulkopuolella. Hänestä tuli myös Jinnahin läheinen neuvonantaja. Hän auttoi Jinnahia kasvattamaan tyttärensä Dina Wadian. Tytär meni naimisiin kristinuskoon kääntyneen parasilaisen Neville Wadian kanssa. Jinnah ei pitänyt tästä avioliitosta, mutta jatkoi kirjeenvaihtoa tyttärensä kanssa.
Muslimiliiton johtaja
Monet Intian muslimijohtajat, kuten Aga Khan III, Coudhary Rahmat Ali ja Sir Muhammad Iqbal, pyysivät Jinnahia palaamaan Intiaan.
Muslimiliiton johtajat halusivat, että hän ottaisi Muslimiliiton johtoonsa. Jinnah suostui palaamaan Intiaan. Vuonna 1934 hän lähti Lontoosta ja palasi Intiaan järjestääkseen Muslimiliiton uudelleen. Hän pystyi kuitenkin elvyttämään puolueen asemaa vasta vuoden 1937 vaalien jälkeen, sillä Muslimiliitto voitti vain muutamia paikkoja. Liigaa auttoi kuitenkin tuolloin Punjabin vaikutusvaltainen pääministeri Sir Sikandar Hayat Khan. Lokakuussa 1937 hän suostui siihen, että Jinnahin Muslimiliitto liittyi hänen vahvaan hallitukseensa. Tätä kutsuttiin Jinnah-Sikandar-sopimukseksi.
Hänen erimielisyytensä kongressipuolueen kanssa syvenivät entisestään. Vuonna 1930 eräät muslimijohtajat, kuten Allama Iqbal, olivat vaatineet erillisen maan perustamista Intian muslimiväestölle. Lopulta hän tuli siihen tulokseen, että hindut ja muslimit eivät voi elää samassa maassa. Myös Jinnahilla alkoi olla ajatus erillisestä maasta Intian muslimeille. Jinnah ja Muslimiliitto aloittivat työn tällaisen erillisen maan saamiseksi. He tekivät tätä varten vuonna 1940 suunnitelman, jota kutsutaan Pakistanin päätöslauselmaksi. Uuden maan nimeksi tuli Pakistan.
Vuonna 1941 Jinnah perusti sanomalehden nimeltä Dawn. Lehti julkaisi Muslimiliiton näkemyksiä ja poliittista ajattelua. Toisen maailmansodan aikana Jinnah tuki brittejä ja vastusti kongressipuolueen Quit India -liikettä. Vuonna 1944 Gandhi kävi 14 neuvottelukierrosta Jinnahin kanssa, mutta he eivät päässeet sopimukseen. Tähän mennessä Muslimiliitto oli muodostanut hallituksia joihinkin maakuntiin ja päässyt myös keskushallintoon.
Pakistanin perustaja
Toisen maailmansodan jälkeen Iso-Britannia ryhtyi toimiin Intian itsenäistämiseksi. Britit ilmoittivat 16. toukokuuta 1946 suunnitelmasta yhdistyneen Intian perustamiseksi. Kuukautta myöhemmin, 16. kesäkuuta 1946, britit ilmoittivat toisen suunnitelman, jonka mukaan Britannian hallintoalue jaettaisiin kahteen maahan, joista toinen olisi hindujen ja toinen muslimien maa.
Kongressipuolue hyväksyi 16. toukokuuta 1946 tehdyn suunnitelman. Muslimiliitto Jinnahin johdolla hyväksyi molemmat suunnitelmat. Mutta 16. elokuuta 1946 Jinnah ilmoitti myös suorista toimista Pakistanin, entisen Britannian Rajin muslimien erillisen maan, itsenäisyyden saavuttamiseksi. Useiden keskustelukierrosten jälkeen Britannian hallintoalue jaettiin (elokuussa 1947) kahdeksi maaksi, Intiaksi ja Pakistaniksi. Vuonna 1971 Bangladesh itsenäistyi Pakistanista.
Kenraalikuvernööri
Brittiläinen Intian hallintoalue jaettiin kahdeksi maaksi, Intiaksi ja Pakistaniksi. Jinnahista tuli Pakistanin ensimmäinen kenraalikuvernööri, ja hänen sisarestaan Fatimah Jinnahista tuli "kansakunnan äiti". Hänestä tuli myös Pakistanin perustuslakia säätävän kokouksen puheenjohtaja. Perustavalle kokoukselle 11. elokuuta 1947 pitämässään puheessa Jinnah kertoi Pakistanin tulevaisuudesta maallisena valtiona. Hän kertoi tämän seuraavin sanoin:
Voit kuulua mihin tahansa uskontokuntaan, kastiin tai uskontokuntaan - sillä ei ole mitään tekemistä valtion asioiden kanssa. Ajan myötä hindut lakkaavat olemasta hinduja ja muslimit lakkaavat olemasta muslimeja, ei uskonnollisessa mielessä, koska se on jokaisen henkilökohtainen usko, vaan poliittisessa mielessä valtion kansalaisina.
Jinnah otti myös suoran vastuun hallituksesta. Jakautumisen jälkeen muslimien ja hindujen välillä tapahtui laajamittaista väkivaltaa. Väkivaltaisuudet olivat hyvin vakavia Punjabissa ja Bengalissa. Jinnah kiersi alueilla yhdessä Intian hindujohtajien kanssa rauhoittelemassa väestöä. Monet ihmiset kuolivat väkivaltaisuuksissa. Arviot kuolemantapauksista vaihtelevat kahdesta sadasta tuhannesta yli miljoonaan kuolleeseen. Jinnah oli henkilökohtaisesti hyvin surullinen kaikista näistä tapahtumista.
Pian Intian ja Pakistanin itsenäistymisen jälkeen Kashmirissa puhkesi aseellinen konflikti. Kashmirin kuningas oli suostunut siihen, että Kashmirista tulisi osa Intiaa, mutta suurin osa Kashmirin muslimeista ei pitänyt tästä. He alkoivat taistella Kashmirissa. Intia joutui lähettämään joukkojaan Kashmiriin, josta oli tullut osa Intiaa. Intia nosti asian esille Yhdistyneissä kansakunnissa. Yhdistyneet kansakunnat määräsi konfliktin päättymään ja kansanäänestyksen. Tämä ongelma vaikuttaa edelleen huonosti Intian ja Pakistanin suhteisiin.
Jinnahin rooli Pakistanin luomisessa uudeksi kansakunnaksi oli hyvin tärkeä. Tämä teki hänestä hyvin suositun Pakistanin kansan keskuudessa. Itä-Pakistanissa (nykyisessä Bangladeshissa) vastustettiin Jinnahin näkemystä, jonka mukaan urdun kielen pitäisi olla ainoa kansalliskieli.