Vuoden 2006 Tour de France oli 93. Tour de France. Se järjestettiin 1.-23. heinäkuuta 2006. Voittaja oli Óscar Pereiro. Floyd Landis ajoi ensimmäisenä maaliin, mutta hänet hylättiin 20. syyskuuta 2007, koska hän oli ottanut testosteronilääkettä kilpailun 17. etapin aikana.
Kiertue alkoi Strasbourgista, Ranskan ja Saksan rajalta. Se päättyi sunnuntaina 23. heinäkuuta Pariisiin. Kilpailun pituus oli 3657 km (2272 mi). Kilpailu oli keskinopeudeltaan kolmanneksi nopein. Matkan varrella pyöräilijät kulkivat kuuden eri maan läpi: Ranska, Alankomaat (pysähdys Valkenburgissa 3. etapilla), Belgia (Huy, 3. ja 4. etapilla), Luxemburg (Esch-sur-Alzette, 2. ja 3. etapilla), Saksa (tosin pysähtymättä siellä, 1. etapilla) ja Espanja (Pla-de-Beret, 11. etapilla). Ensimmäistä kertaa sitten vuoden 1999 kisan ei järjestetty joukkueiden aika-ajoa.
Päivää ennen Tourin alkua sattui dopingskandaali. Tourilta poistettiin 13 kilpailijaa, koska heidän uskottiin saaneen lääkkeitä Fuentes-nimiseltä lääkäriltä. Kahden 13 ajajan odotettiin pärjäävän kilpailussa hyvin. He olivat Jan Ullrich ja Ivan Basso.
Voittajuuden käsittely ja Floyd Landisin tapaus: Alkuperäiset sijoitukset muuttuivat sen jälkeen, kun kilpailun ensimmäiseksi tullut Floyd Landis todettiin dopingin takia hylättäväksi. Landisin näytteissä todettiin poikkeavuuksia testosteronitasoissa, ja antidoping-prosessien edetessä hänet virallisesti julistettiin kilpailusta eristetyksi 20. syyskuuta 2007. Tämän seurauksena toiseksi tullut Óscar Pereiro nimettiin viralliseksi voittajaksi. Tapauksen käsittely herätti paljon keskustelua antidoping-valvonnan menetelmistä ja oikeudellisista prosesseista urheilussa.
Fuentes-skandaalin vaikutus kilpailuun: Operación Puerto -tutkinnan yhteydessä paljastunut Fuentes-verkosto johti siihen, että useita nimekkäitä kilpailijoita suljettiin Tourista ennen lähtöä. Poistettujen joukossa oli kilpailun suosikkeihin laskettuja ajajia, kuten Jan Ullrich ja Ivan Basso, minkä vuoksi kilpailun lähtölista ja odotukset muuttuivat nopeasti. Skandaali vaikutti myös yleisön ja median kiinnostukseen – koko Tour jäi osin dopingskandaalien varjoon.
Reitin ja kilpailun luonne: Vuoden 2006 reitti yhdisti pitkiä siirtymiä, vaativia vuoristoetappeja ja useita aika-ajoja, muun muassa ratkaiseva 17. etappi, jossa Landis saavutti alkuperäisen tuloksensa. Pla-de-Beretin nousu 11. etapilla oli yksi vuoristokohokohdista. Koska joukkueaika-ajoa ei ollut, kilpailu painotti yksilösuorituksia ja vuoristossa sekä tempoissa tulleita hetkellisiä eroja.
Jälkivaikutukset ja muistiin jäänyt kausi: Tour 2006 muistetaan vahvasti dopingskandaaleista: sekä Fuentes-juurteista että yksittäisistä positiivisista näytteistä, jotka johtivat kilpailutulosten muuttumiseen. Tapaukset lisäsivät painetta tiukentaa testauskäytäntöjä ja herättivät pitkän keskustelun pyöräilyn puhtauden puolesta. Urheilullisesti kausi toi esiin myös, miten nopeasti suursuosikit voivat poistua kuvioista ja miten kilpailun kulku voi muuttua poikkeuksellisten tapahtumien myötä.